灵活用工和代发工资有什么区别？代发工资：每月发工资100万，这100万的人员工资做进企业成本，不能进行抵扣，其次员工工资高点需要缴纳个税。灵活用工：100万员工工资通过平台发放，平台给企业提供100万增值税专用发票，可以进行进项抵扣，其次每人每月9.8万以内免征增值税、个税。