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浪潮信息助力昆明植物所,加速天然药物研发进程~~

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云南,这片被誉为“动植物王国”的神奇土地,拥有全国首屈一指的生物多样性资源,成为植物认知、药物研发和植物多样性保护的前沿阵地。植物天然产物的研究和药物开发需要多学科交叉融合,充满未知与挑战。浪潮信息通过构建集科学计算、大数据存储和智能化管理于一体的多学科计算服务平台,为植物天然产物挖掘、药物活性成分探寻及新药创制注入了全新动力,推动科研从传统手段向数据驱动的方式转型。
植物天然产物研究和药物研发需要生物学、化学、物理学与药学等多个学科交叉研究,充满了未知与挑战。随着科研工作的不断深入,传统的研究手段逐渐变为由数据驱动的方式,通过计算机模拟可以加速植物天然产物及其相关药物的研发进程,发掘更深层次的科学问题。

为此,浪潮信息为中国科学院昆明植物所构建了一个集科学计算、大数据存储和智能化管理于一体的多学科计算服务平台,为植物天然产物挖掘、药物活性成分探寻、化合物分子精细建模与优化,以及新药创制等一系列复杂科研流程注入新的动力。


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从植物天然产物到药物研发,多学科应用融合的荆棘之路
构建完善的研发体系需要海量科学大数据的积累,从而支撑植物学、植物天然产物化学、药物学等科研领域的深入研究,这对于认识、利用和保护植物多样性以及发现植物天然产物药物具有重要意义。然而,随着新技术和新应用的不断涌现,科研数据量和计算量呈现指数级增长,这使得全新规划的多学科计算服务平台建设面临着前所未有的挑战。
如今,生物大分子模拟、核酸分析等计算密集型应用在科研任务中广泛使用,对于算力的需求也是水涨船高。以研究多糖类药物合成过程为例,糖分子因其独特、复杂的结构与功能,难以用常规遗传密码解读,需要利用Amber等分子动力学应用开展生物大分子计算模拟, 以直观地展现糖分子在溶液环境中的构象变化情况,预测不同合成策略下得到的糖分子结构特征,对比分析哪种方案更有可能合成出具有理想活性的目标糖分子。这个过程涉及到大量原子间相互作用,以及复杂的化学键变化等诸多精细且繁杂的计算,同时要保证模拟的准确性和精度,哪怕仅运行数微秒到数十微秒,对算力的需求也十分巨大。
此外,在植物研究过程中将产生大量的科研数据,需要采集处理高达数TB到数PB的数据,涵盖了植物样本采集阶段的基础信息记录、实验处理环节的各类参数设定、分析过程中产生的各层级多组学数据。以药用和濒危物种研究为例,需要运用高通量筛选(HTS)技术,对植物样品材料深度剖析,以获取相关基因组和nrDNA序列,构建起精准鉴定参考数据集。这要求存储系统不仅具备高性能、高可靠性、高可扩展性,还需要与原有云平台无缝对接,实现数据的自由流通与共享。
因此,多学科计算服务平台作为各大项目组的统一算力和存储支撑平台,必须依据不同应用的独特需求,设计出清晰合理的数据流向,搭建统一、智能的计算资源管理体系,确保算力、存储、网络资源的高效利用,避免资源闲置或冲突。


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