广州东站的值班员属于客运部门。客运部门是铁路站点的重要部门之一，负责站点内的客运业务和服务工作，包括旅客运输、货物运输、售票、检票、行李托运等方面。广州东站是广州市的一个铁路交通枢纽站，是国家铁路网的重要组成部分，客运业务量大，需要有专业的客运人员进行管理和服务。因此，广州东站的值班员属于客运部门。