秦汉时期的地方行政机构主要包括郡和县。郡是地方行政的最高单位，下设若干县。郡守是郡的最高行政长官，由中央政府任命，负责管理辖区内的政治、经济、军事、司法等事务。县是郡下设的行政单位，下辖数个乡、镇、村等基层行政单位，县令是县的最高行政长官，由郡守任命。