1． 商标问题：目前商标滥用是最普遍的知识产权侵权问题，《中华人民共和国商标法》的规定，未经商标注册人许可，在同一种商品或者类似商品上使用与其注册商标相同或者相似商标的，均属于侵犯商标权的行为。在电子商务过程中，对于商标许可使用，例如网络上建立连锁店的注册商标许可等这些隐形商标在保护方面必须要注册，申请驰名商标权利，争取法律保护。

2． 版权问题：电子商务交易是受到知识产权的法律保护的。国家相关法律规定，无论有形的实物还是无形的虚拟的买卖物体一旦注册了知识产权保护就不得他人复制这些信息从而获利。电子商务网站集会的信息无论是什么形式，只要其内容符合著作权法要求的，都予以版权保护。
　3． 域名问题：域名即因特网协议地址，是因特网络上与该计算机的因特网协议IP地址相对应的识别和定位计算机的层次结构式的字符识别。任何企业、单位参与电子商务的基本前提是必须要在因特网上拥有自己的IP地址。域名是一种资源标志符，一旦一方事先注册就不得他人再次使用。对于注册域名后的转让或者许可使用所产生的纠纷，则可以通过当事人的约定解决。

4． 专利问题：每产生一种实体产品，一经上市都会有属于自己的专利权，在电子商务形势下，网络销售的专利也不容忽视，所以即使是网络下的物品或是资源销售等都应申请自己的商品的相关专利！这样大大的保护了商品的专利问题，同时也受法律保护！
　5． 商业秘密问题：商业秘密一旦传播在某种程度上是很严重的，加之网络传输非常便利，这样要保守商业秘密的程度就更加困难。所以要注意下载、转载、读取，等行为。