环境因素
金鱼生活在水中，对于光照、水质和水温的变化十分敏感。特别是水温的变化，金鱼可以承受的极限水温的突然变化是4摄氏度。超过这一限度就必然会生病，甚至造成死亡。因此在给金鱼换水及换缸时要注意新旧水温度的变化。另外水质的硬度和酸碱度的突然变化，也会影响到金鱼生物保护膜，从而引起金鱼生病。
正确的做法是：换水之前将新水晾晒3天，使新旧水温相差在一摄氏度以内，并且挥发水中的氯气。换水量保持在1/2以下，并且徐徐注入新水。紧急时可以在新税种添加水质稳定剂，快速去除水中的有害物质。添加开水并用温度计测量水温升至与旧水接近即可使用。但对于名贵品种不宜常用。如果长时间光照太弱或者太强也会对金鱼的体色以及生长产生影响。水中的溶氧量也是关键因素，如果溶氧量过低则鱼会浮头，重则引起窒息死亡。解决溶氧量最容易的办法是使用水族专用增氧泵。并根据水容积选择合适的功率。另外使用外循环过滤的方法也可以增加水中氧气含量。对于由于金鱼代谢物所产生的有害物质可以采用换水以及添加硝化细菌将的方法解决。

物理损伤
在移动金鱼的过程中，容易造成对金鱼体表的损伤，严重的会造成金鱼内脏破裂，造成死亡。另外在水族箱中如果有尖锐的饰物，如珊瑚石、塑料水草等等，也会发生水泡刺破、珠麟刮落的情况。甚至由于水泵吸力过强或水流流苏过快都会产生物理损伤的危险。因此在移动金鱼时，推荐使用水瓢捞鱼，动作要轻快，不然也会由于金鱼的挣扎而造成损伤。水族箱中的设备和饰物要表面光滑材质柔软。水泵的入水口可以假装生化过滤棉（俗称水妖精）。过滤器的注水口加装弯管，减少水流冲击。

细菌感染
金鱼生活在水中，由于水的空间有限，而且水是静止的，极容易滋生细菌，从不同的地方购买的金鱼也可能带来病毒。另外腐败的食物也会引起金鱼患上肠炎。对于由于病菌感染所产生的疾病要勤观察、早治疗、早隔离，对于病入膏肓的病鱼要果断淘汰。

家庭中治疗金鱼疾病常用的治疗手段主要包括：药浴、药饵、机械矫正。
药浴：
通常采用一定浓度的药液浸泡鱼体，由于病菌感染造成的鱼病，常使用全缸低浓度泼洒的方法。比较常用的药物包括：盐、呋喃西林、亚甲基蓝、红药水等等，以上药物毒性较小，适合家庭中使用。
药饵：
是将中西药，如土霉素、大蒜素掺入饲料之中，喂养病鱼。可以从市场上购得制成品使用。
机械矫正：
对于金鱼鱼鳔生病，可以绑缚泡沫塑料在鱼鳍上，扶助金鱼游动。


观察金鱼体表是否存在寄生物，长白毛、白点，出血，溃烂，金鱼体表疾病的判断方法比较复杂，药剂使用计量复杂，家庭养鱼无需特别学习，只需要按照以下土法防治即可。
药名 浓度 治疗
盐 千分之三用于治疗千分之一用于预防 体表细菌性疾病
呋喃西林 40公斤的水中，加入一个火柴头大小的原粉，用少量白酒化开 体表细菌性疾病和肠炎
高锰酸钾 将鱼捞出，直接在水中添加高锰酸钾直至水呈樱红色，浸泡半天全缸换水 清缸消毒
亚甲基蓝 直接添加，至水呈海蓝色 体表细菌性疾病
红药水 将鱼捞出，直接涂抹患处，离水保持十秒 溃烂
除了以上传统药品以外，还可在行家指导下购买市场出售的专用药剂使用，并严格参照使用计量说明。